Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA3AQ14563 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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