Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNW1Q13573 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNW1Q13573 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms