Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GAB1Q13480 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms