Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3BPQ13352 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB3BPQ13352 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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