Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLAMF1Q13291 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLAMF1Q13291 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLAMF1Q13291 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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