Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNK2Q07912 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNK2Q07912 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms