Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OC90Q02509 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OC90Q02509 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OC90Q02509 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OC90Q02509 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OC90Q02509 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OC90Q02509 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OC90Q02509 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OC90Q02509 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms