Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSF1Q00613 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms