Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms