Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOMO3P69849 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOMO3P69849 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms