Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P63132 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms