Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBX4P57082 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBX4P57082 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX4P57082 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX4P57082 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX4P57082 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX4P57082 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX4P57082 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX4P57082 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TBX4P57082 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX4P57082 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX4P57082 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms