Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUMO3P55854 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUMO3P55854 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms