Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A3P53794 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms