Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2E1P51965 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms