Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMAN1P49257 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN1P49257 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms