Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
XCR1P46094 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
XCR1P46094 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
XCR1P46094 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
XCR1P46094 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XCR1P46094 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XCR1P46094 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XCR1P46094 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XCR1P46094 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XCR1P46094 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XCR1P46094 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms