Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSFMP43897 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSFMP43897 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSFMP43897 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSFMP43897 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSFMP43897 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSFMP43897 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSFMP43897 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSFMP43897 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSFMP43897 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSFMP43897 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TSFMP43897 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSFMP43897 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSFMP43897 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSFMP43897 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSFMP43897 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSFMP43897 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TSFMP43897 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TSFMP43897 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms