Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER3P43115 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms