Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTGFRP43088 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms