Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTHFRP42898 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTHFRP42898 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms