Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPGP40121 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPGP40121 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAPGP40121 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPGP40121 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPGP40121 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPGP40121 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPGP40121 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPGP40121 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPGP40121 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPGP40121 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPGP40121 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPGP40121 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPGP40121 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms