Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A4P31645 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms