Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5AP29375 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms