Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB2P29033 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB2P29033 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB2P29033 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB2P29033 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB2P29033 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB2P29033 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB2P29033 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB2P29033 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB2P29033 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB2P29033 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB2P29033 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB2P29033 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB2P29033 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms