Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATF3P18847 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATF3P18847 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATF3P18847 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATF3P18847 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATF3P18847 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATF3P18847 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATF3P18847 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF3P18847 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF3P18847 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF3P18847 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF3P18847 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF3P18847 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATF3P18847 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATF3P18847 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATF3P18847 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ATF3P18847 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATF3P18847 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATF3P18847 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATF3P18847 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATF3P18847 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATF3P18847 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATF3P18847 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATF3P18847 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATF3P18847 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms