Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB6P18564 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms