Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTRB1P17538 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms