Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA6P17066 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPA6P17066 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA6P17066 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms