Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZNF3P17036 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF3P17036 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms