Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRAFP15056 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRAFP15056 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRAFP15056 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRAFP15056 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRAFP15056 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRAFP15056 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRAFP15056 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRAFP15056 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAFP15056 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms