Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT13P13646 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT13P13646 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT13P13646 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT13P13646 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT13P13646 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT13P13646 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms