Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODC1P11926 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODC1P11926 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODC1P11926 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ODC1P11926 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ODC1P11926 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODC1P11926 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODC1P11926 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODC1P11926 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODC1P11926 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ODC1P11926 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ODC1P11926 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ODC1P11926 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ODC1P11926 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODC1P11926 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODC1P11926 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODC1P11926 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODC1P11926 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODC1P11926 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODC1P11926 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODC1P11926 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODC1P11926 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms