Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM1P11229 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM1P11229 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms