Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALM3P0DP25 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CALM3P0DP25 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms