Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC159P0C7I6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms