Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP1P09874 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP1P09874 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP1P09874 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP1P09874 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP1P09874 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PARP1P09874 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP1P09874 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP1P09874 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP1P09874 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms