Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBP1P09455 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBP1P09455 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP1P09455 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP1P09455 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP1P09455 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP1P09455 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP1P09455 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBP1P09455 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBP1P09455 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms