Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PKHD1P08F94 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PKHD1P08F94 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PKHD1P08F94 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PKHD1P08F94 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PKHD1P08F94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PKHD1P08F94 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PKHD1P08F94 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PKHD1P08F94 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PKHD1P08F94 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PKHD1P08F94 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PKHD1P08F94 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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