Protein–RNA interactions for Protein: P04553

PRM1, Sperm protamine P1, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM1P04553 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PRM1P04553 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PRM1P04553 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms