Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A1P02462 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A1P02462 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A1P02462 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A1P02462 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A1P02462 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A1P02462 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A1P02462 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A1P02462 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A1P02462 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COL4A1P02462 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A1P02462 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A1P02462 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COL4A1P02462 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL4A1P02462 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms