Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCAP01258 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCAP01258 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCAP01258 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCAP01258 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCAP01258 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCAP01258 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCAP01258 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCAP01258 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCAP01258 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCAP01258 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCAP01258 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCAP01258 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCAP01258 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCAP01258 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCAP01258 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCAP01258 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms