Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms