Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5O60239 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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