Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C21orf2O43822 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C21orf2O43822 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
C21orf2O43822 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C21orf2O43822 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms