Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP8B1O43520 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms