Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms