Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
H7C1D1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H7C1D1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H7C1D1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H7C1D1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1D1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1D1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1D1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1D1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H7C1D1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H7C1D1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1D1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1D1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1D1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1D1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H7C1D1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C1D1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C1D1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C1D1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
H7C1D1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H7C1D1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H7C1D1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H7C1D1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1D1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1D1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1D1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1D1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1D1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H7C1D1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms