Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
H3BQV1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H3BQV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H3BQV1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H3BQV1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H3BQV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H3BQV1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H3BQV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
H3BQV1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
H3BQV1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms