Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00587B1AMM8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms